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Projet européen MetaFluidics

L’objectif du projet européen MetaFluidics est de développer une plateforme technologique dédiée à l’identification de gènes d’intérêt biotechnologique à partir de métagénomes, qui représentent l’ensemble des génomes microbiens présents dans les échantillons environnementaux.

C’est parti pour 4 ans de recherche à la pointe des biotechnologies !

L’équipe CIMEs (Catalyse et Ingénierie Moléculaire Enzymatiques) du LISBP (Laboratoire d’Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés de l’INSA Toulouse) exploitera les dernières avancées de la microfluidique pour élargir le catalogue d’enzymes disponibles dans la nature, mais encore verrouillées dans la fraction non-cultivée des écosystèmes microbiens. Des méthodes de criblage à ultra-haut débit seront développées pour accélérer la découverte de nouvelles voies de métabolisation des glycanes, à fort potentiel pour les biotechnologies industrielles et le contrôle du fonctionnement des écosystèmes.

 

Depuis le lancement du projet en juin 2016, plusieurs actions ont déjà été menées par les partenaires, comme la collecte d’échantillons issus de sources chaudes, de compost, de fumier ou d’environnements froids, sous haute pression, salins, etc. L’enrichissement ex-situ et in-situ de ces échantillons, ainsi que le séquençage des métagénomes, se poursuivront dans les mois à venir dans le but de construire des banques métagénomiques et métaviromiques. En parallèle, de nouveaux systèmes microfluidiques à gouttes sont en cours de développement et testés pour identifier de nouvelles séquences d’ADN ou enzymes d’intérêt et de nouveaux outils et algorithmes bioinformatiques sont également développés. Grâce au travail intense et à la coopération déjà menés, les premiers hits ont déjà pu être isolés.

 

Depuis septembre 2016, l’équipe de MetaFluidics a participé à la conférence Metagenomics 2016 en Norvège, ainsi qu’au workshop organisé par la Commission Européenne sur l’impact des Key Enabling Technologies (Technologies Clés Génériques) dans les projets Horizon 2020. Dans le cadre du projet, un workshop de bioinformatique a également été organisé par Qiagen Aarhus sur l’utilisation du logiciel  CLC Genomics Workbench.

 

Le projet MetaFluidics est financé à hauteur de plus de 8,8 millions d’euros par Horizon 2020, le programme de recherche et innovation de l’Union Européenne (Appel “Metagenomics as an innovation driver” du pilier « Industrial Leadership »). Ce projet est coordonné par l’Université Autonome de Madrid ; il rassemble 13 partenaires (5 entreprises, 4 universités et 4 organismes de recherche) issus de 6 pays européens différents (Danemark, Espagne, France, Norvège, Portugal et Royaume-Uni).

 

Contacts :

- Laure Fabre, responsable de la dissémination et communication : fabre @ insa-toulouse.fr

- Gabrielle Potocki-Veronese, responsable scientifique pour l’INSA Toulouse veronese @ insa-toulouse.fr

 

Pour plus d’informations : www.metafluics.eu, ou suivre les avancées du projet sur les réseaux sociaux :

 

 

 

This project has been funded by the European Union´s Horizon 2020 Research and Innovation Programme under the Grant Agreement N° 685474.