Ingénierie génétique et enzymatique

Objectifs

A la fin de ce module, létudiant devra avoir compris et pourra expliquer (principaux concepts) :
Ingénierie enzymatique :
Comprendre les outils numériques danalyse bioinformatique pour i) lassemblage et lannotation des génomes, ii)lanalyse des génomes et lanalyse structurale des protéines iii) la compréhension des mécanismes daction et lingénierie des catalyseurs.
Ingénierie génétique
Comprendre et expliquer les principales approches dingénierie génétique utilisées en biologie synthétique.
Comprendre les méthodes de recherche bibliographique dans les bases de données scientifiques pour réaliser une synthèse et un exposé bibliographique.

Létudiant devra être capable de :
Ingénierie enzymatique
Décrire les méthodes danalyse bioinformatique des génomes et des structures protéiques (alignement de séquences, logiciel de graphisme et modélisation moléculaire). Utiliser ces outils pour la compréhension des relations structure activité et lingénierie des enzymes.
Ingénierie génétique
Connaître et utiliser les bases de données pour la recherche darticles scientifiques
Construire et rédiger une étude bibliographique
Connaître et présenter différentes approches et méthodes entrant dans le champ de lingénierie génétique

Ingénierie enzymatique
Rappel sur la structure des protéines. Outils informatiques de traitements des séquences Outils informatique danalyse de structure 3D: Initiation au graphisme et à la modélisation moléculaire / application à la comparaison des structures 3D au ciblage de mutations pour lingénierie/ Etude de cas : enzymes de la famille des -amylases.
Ingénierie génétique
Réalisation dune revue bibliographique (restituée sous forme de rapport) entrant dans le champ thématique de lingénierie génétique (édition de génomes, ingénierie de microorganismes, techniques de métagénomiques, expression de gènes, etc...). Présentation des connaissances acquises à la promotion complétée par lanalyse et lexposé oral dun article sélectionné.

Pré-requis

Connaissances en Biochimie et Biologie moléculaire

Evaluation

L'évaluation des acquis d'apprentissage est réalisée en continu tout le long du semestre. En fonction des enseignements, elle peut prendre différentes formes : examen écrit, oral, compte-rendu, rapport écrit, évaluation par les pairs...